erdweibchen: (Default)
[personal profile] erdweibchen
После отпуска, плавно перешедшего в затяжной сумасшедший дом по всем фронтам (вошедший таки в конце концов в берега :), уж не знаю, надолго ли), возвращаюсь к нашим клиническим баранам. Согласно плану, в этот раз я буду писать про исходы, они же endpoints.
В части первой с продолжением я немножко рассказала о том, какими способами при проведении клинического исследования исключают влияние посторонних факторов на результат, чтобы оценить именно эффективность новой терапии, а не, скажем, средний возраст тех, кто ее выбирает, и об иерархии типов исследования с точки зрения надежности исключения постороннего влияния на результат.

Сегодняшний пост посвящен вопросу, а что такое, собственно, результат применения терапии? В идеале результат, с точки зрения здравого смысла - пациент вылечился, ну или по крайней мере ему стало лучше. А что значит - "вылечился", и что значит - "лучше"?

Обычно успех терапии можно померить разными параметрами. Например, результат применения нового лекарства, снижающего артериальное давление, можно померить (пример гипотетический, если кто-то из врачей скажет, что давление так никто не меряет, спорить не буду):

- как снижение давления в состоянии покоя, через, скажем, три недели после начала приема лекарства,
- как снижение давления под нагрузкой, через четыре недели после начала приема лекарства,
- как среднее давление через три недели, четыре, пять, шесть и семь (чтобы исключить флуктуации, связанные, например, с тем, что через три недели пациент был случайно именно в тот день очень зол на тещу), в сравнении со средним давлением контрольной группы,
- как снижение среднего давления по пяти измерениям в течение суток, через два месяца после начала приема,
- как снижение числа гипертонических кризов в месяц, требующих вызова неотложки, через два года после начала приема, в сравнении с контрольной группой,
- как снижение числа инсультов в течение пяти лет приема, в сравнении с контрольной группой,
- как снижение смертности за десять лет приема, в сравнении с контрольной группой,
и т.д.

Важно: выбор исхода ("конечной точки", endpoint), по которой будут измерять успех/неуспех препарата, производится до начала исследования и фиксируется в его протоколе. Потому что вероятность случайно получить статистически достоверную разницу между экспериментальной и контрольной группой, хотя на самом деле никакой разницы нет, можно контролировать только в этом случае. Если же исследователь, спланировав изучить, как L-carnitine влияет на вес, и обнаружив через год, что вообще-то никак, решит померить не вес, а объем талии (а если с талией тоже не получилось, то диаметр ног в районе икр, а если там тоже все безнадежно, то хотя бы субъективные ощущения испытуемых от своей фигуры), то чем больше параметров он переберет, тем выше вероятность, что рано или поздно он таки найдет тот, где разница случайно получилась именно на этой выборке (хотя в реальности ее нет). Это называется fishing и является самым страшным грехом биостатистика. :)

Пожалуй, чтобы пояснить, чем fishing так ужасен, я немножко перекрою план и сначала расскажу, что значит "статистически достоверная разница" и как переносить результаты исследования в жизнь (планировалась частью третьей), а потом вернусь к видам исходов и почему важно эти виды не путать. Продолжение на днях.

Date: 2008-10-14 09:55 pm (UTC)
From: [identity profile] froken-bock.livejournal.com
Сегодняшний пост посвящен вопросу, а что такое, собственно, результат применения терапии?

Давече главный начальник рассказывал с графиками, что оттестированная нами терапия при раке предстательной железы выходит на рынок. Суть графиков - примерно 6-месячное увеличение продолжительности жизни. Пара-тройка графиков провоцирует канцерофобию даже у профессионально деформированных..

Date: 2008-10-14 10:04 pm (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
С онкологическими терапиями такая штука - их все тестируют сначала на пациентах, где все (или по крайней мере многое) остальное уже испробовано. Следующим шагом терапии тестируют тоже в паллиативной ситуации, но в не так далеко зашедшей; и только потом терапию тестируют в ситуации в принципе излечимой онкологии.

Если на терапированных-перетерапированных паллиативных пациентах получается шестимесячное увеличение продолжительности жизни - то это вообще-то дофига, и в ситуации early stage такой медикамент, скорее всего, даст ощутимое повышение процента ремиссий.

Но в общем не без того. Я early stage исследования больше люблю, да; и именно потому.

У нас есть одно исследование (обсервационное) рака груди при беременности. Вот оно меня неизменно в депрессняк вгоняет, когда я что-нибудь для него делаю.

Date: 2008-10-14 10:06 pm (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Ты, кстати, важный вопрос зацепила, надо его куда-нибудь в план тоже утрамбовать (наверное, в следующий кусок и упакую) - отличие статистической достоверности от клинической релевантности.

Date: 2008-10-14 10:19 pm (UTC)
From: [identity profile] lilipu.livejournal.com
Вот почитаешь такое, и начнешь сомневаться: а может, эти йогонутые целители кристаллами не такие идиоты?

Date: 2008-10-15 06:05 am (UTC)
From: [identity profile] neiztvoegorebra.livejournal.com
А что, L-carnitine действительно не влияет? Или не влияет один, без ансамбля?

Date: 2008-10-15 06:37 am (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Вроде, не влияет (http://progenes.livejournal.com/42885.html).
Там на уровне биохимии расписано, почему, и ссылка на исследования есть.

Date: 2008-10-15 06:23 am (UTC)
From: [identity profile] samtaburetkin.livejournal.com
Книжку Harrell, Regression Modeling Strategies, ты ведь знаешь, да? Я так просто спросил, на всякий случай.

Date: 2008-10-15 06:32 am (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Ага. Она у меня (в отвратительной ксерокопии, к сожалению) на полке стоит. :)

А что?

Date: 2008-10-15 10:02 pm (UTC)
From: [identity profile] samtaburetkin.livejournal.com
ну, он там всё очень толково рассказывает. Особенно про эти все multiple testing.

я ж говорю, я так просто спросил :))

Date: 2008-10-16 08:23 am (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Кстати, ты ж мне ее, по-моему, и посоветовал в свое время. Я ей активно пользуюсь для одного проекта, который выходит далеко за рамки испытания медикаментов.

Но я-то сейчас пишу не про exploratory проекты, а (причем сильно упрощая) про КИ, по результатам которых лекарства регистрируют/рекомендуют к применению. А там чтоб регрессионный анализ был заложен в протокол как primary - честно говоря, ни разу не видела. :) Обычно дизайн такого КИ прост и скучен, как валенок - рандомизацией делим испытуемых на группы, молимся, чтоб группы оказались в конце концов сбалансированы по всяким известным факторам (иногда помогаем пинком стратификацией рандомизации по критическим параметрам), лечим, мерим исход и сравниваем группы при помощи какого-нибудь древнего, скучного и надежного статистического теста - хи-квадрата (ну или точного Фишера), т-теста, лог-ранк, если у тебя time to event. Multiple testing там играет роль в лучшем случае при закладывании в протокол промежуточных анализов.

Вся интересная статистика выгружена в secondary, которые explorative и генерирование гипотез. Про них я, может быть, когда-нибудь тоже напишу; но не скоро. :)
Edited Date: 2008-10-16 08:24 am (UTC)

вот тут мимо пробежало

Date: 2008-10-22 10:06 pm (UTC)
From: [identity profile] samtaburetkin.livejournal.com
FREELANCE Pre-Clinical Statistician - Must speak fluent German


Start Date - Within the next 2 months ideally, January at the latest.
Contract Length - 6 months rolling
Rate: Euros 80 - 110 / hour - Dependant on Experience


Job Summary

The statistician will be responsible for supporting preclinical research at the site, Projects will cover a very wide range of in vitro and in vivo assays. The statistician needs to be able to communicate with TA Scientists, understand study goals and the applied technology, comprehend the data and especially the variation behind it, and provide statistical support (design, analysis, consulting, report, publication, training, etc.). Due to the nature of the preclinical studies (exploratory, new & diverse technologies, high noise, large datasets, molecular targets, etc.), this individual should be interested in and curious about science and technology.


Essential Requirements

* Fluent German Speaker
* Degree qualified, preferably with a biostatistics or statistics
* Relevant pre-clinical/clinical trial biostatistic experience; at least 3 years
* A thorough knowledge of the theory and techniques of applied statistical methods such as, Experimental Designs, ANOVA, Linear Models, non-parametric, regression, correlation analysis, categorical data analysis, survival analysis.
* Solid methodological and analytical skills in traditional statistics and a desire to stay current with literature on novel state-of-the-art methods.
* Exposure to large datasets such as microarray, high throughput screening, SNPs, etc., is desireable.


An excellent opportunity awaits for this renewable contract. Interview times booked and full job specification to review...

If you would to discuss this role in greater detail or your application / suitability to this or further roles, please call me or email me in confidence. If you are not available or suited to this position, please feel free to pass my details on.

We also have a broad variety of other Biometric specific vacancies available in the UK and throughout Europe. Inclusive of SAS programming, Statistical, Clinical programming, Data Management functions, Regulatory Affairs, Clinical Research, QA, Compliance & Validation.

For a confidential consultation call James Carrera on 0044 (0) 207 255 6665 or email your CV to james.carrera@1st-pharmapeople.com

Re: вот тут мимо пробежало

Date: 2008-10-23 06:45 pm (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Ты решил позаботиться обо мне на случай, если экономический кризис охватит Европу? Спасибо. :)
From: [identity profile] samtaburetkin.livejournal.com
Ну, просто такое отчетливое требование -- немецкий язык.

Слушай, кстати, а у вас в Европе биостатистика тоже наводнена китайцами? В Штатах где-то процентов 85-90 докладчиков на всяких биометрических конференциях -- явно азиатского вида, и у большинства явно китайские фамилии. Самые крутые доклады, пожалуй, все-таки белые люди делают, но вот ан масс, тэк скэть -- это все-таки ЮВА.
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Ты знаешь, нет, не наводнена. Тут в основном или местные, или русские.

Но вообще в Европе найти вменяемого биостатистика с опытом работы - нетривиальная задача.
From: [identity profile] samtaburetkin.livejournal.com
социалисты проклятые. Наверно, немецкий язык -- непосильная задача для китайцев.

Date: 2008-10-24 04:27 pm (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Или китайский акцент - для немцев. :)

У нас есть две китаянки в конторе, одна в Data Management, вторая - Medical Writing (кстати, несколько лет назад из Штатов переехала, потому что за немца замуж вышла). Но вот статистиков ни одного не знаю.

Date: 2008-10-15 04:47 pm (UTC)
From: [identity profile] orphanka.livejournal.com
(цыкает зубом) Фишинг - наше все. Фишили, фишим и будем фишить. :)

А разве в биостатистике его нельзя употреблять путем случайного деления выборки на модельную и тестируемую? Многократного. Конечно, если выборка достаточных размеров. На 50-то пациенатах особо не разогнаться, да.

Date: 2008-10-15 04:56 pm (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Альфииинаааа!
Я тебе про Zulassungsstudien и для чайников, а ты мне про генерирование гипотез и для биологов. :)

Можно-то все, главное, публиковать то, что получится, именно как фишинг, а не как результат заранее спланированного теста на подтверждение гипотезы. Ну и не пытаться на его основании медикамент зарегистрировать. :)

Date: 2008-10-15 05:22 pm (UTC)
From: [identity profile] orphanka.livejournal.com
Ну да, за шо я и говорю. :)

К слову, я знаю, что разница между странами а процессе регистрации таки существует. Но вот насколько она существенна...
Ты что-нибудь про это знаешь?

Date: 2008-10-15 05:55 pm (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Кое-что знаю, но я таки статистик, а не юрист и даже не проектменеджер. :) Мы, кстати, Zulassungsstudien не проводим (пока, по крайней мере), потому что это совсем другой уровень бюрократии и контроля качества на каждом этапе (одно только тестирование софта - это на всю жизнь).

Но процедура все больше унифицируется. В Евросоюзе с 95го года сушествует центральная процедура регистрации, которая координируется EMEA; и процедуры отдельных стран подтягиваются под нее. Между Европой и Штатами с вашей FDA есть различия, но независимыми процессами оно тоже давно уже не является. FDA, например, может затребовать отчет по исследованию, которое проводилось в Европе, если медикамент на американском рынке тоже присутствует. Недавно была большая история с профилактическим применением эритропоэтинов в онкологии - возникло подозрение, что они на результате химиотерапии плохо отражаются, так FDA с фармакомпаний затребовала данные по всем исследованиям с участием этих субстанций, в том числе чисто европейских (я в курсе, поскольку мы в доведении до ума одного из них принимали участие); применение эритропоэтинов для первичной профилактики анемии при химиотерапии в результате ограничили (но, кстати, рекомендации EMEA теперь менее консервативные, чем у FDA).
Edited Date: 2008-10-15 06:02 pm (UTC)

Date: 2008-10-17 02:41 am (UTC)
From: [identity profile] orphanka.livejournal.com
Ну, то что исследования туда-сюда катают мне слышать доводилось.
Но хотеоось бы знать - ведь почему-то тех бойцов, что в Британии студентов-добровольцев практически угробили, в Германии не допустили до испытаний на людях. Это случайность или таки правила испытаний (и регистрации) Германии жестче, чем, скажем в Британии.

Date: 2008-10-17 06:26 am (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Я не знаю, есть ли разница в правилах (хотя сомневаюсь, по-моему, британцы свои законы под европейские рекомендации подтянули раньше нас). Но ты ж понимаешь, что одинаковые законы совершенно не означают обязательно одинаковую строгость их исполнения.

У нас институт Пауля Эрлиха, который отвечает за вакцины и моноклональные антитела - это контора, которая из тебя душу вытрясет, если ты к ним чего-нибудь подашь. Они у нас инспекцию проводили (а у нас по их профилю только третья фаза, и субстанции все уже зарегистрированные), дотошные - сил никаких нет. :)
Edited Date: 2008-10-17 06:36 am (UTC)

Date: 2008-10-15 05:59 pm (UTC)
From: [identity profile] erdweibchen.livejournal.com
Да, а про третьи страны не спроси меня - не знаю совсем.

Date: 2008-10-17 02:43 am (UTC)
From: [identity profile] orphanka.livejournal.com
Про третьи страны я тебе сама все расскажу. :)
Там испытаний не проводят, там региструют то, что уже в других странах прошло регистрацию.

Profile

erdweibchen: (Default)
erdweibchen

January 2025

S M T W T F S
   1234
567891011
12131415161718
19 202122232425
2627282930 31 

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jul. 9th, 2025 05:01 pm
Powered by Dreamwidth Studios